Mots-clé
(Anglais)
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Botrytis cinerea, laccase, polygalacturonase, cutinase, stilbene oxidase, lytic enzyme, grape, bloom infection, latency, host specificity, genetic analysis
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Description succincte
(Français)
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Botrytis cinerea peut infecter la vigne dès la floraison. Cette contamination mène à une phase de latence jusqu'à la véraison. La maladie visible se développe après ce stade. La lutte est limitée par la résistance du champignon aux fongicides spécifiques. L'infection primaire est liée à la présence d'enzymes excrétées par le champignon. La caractérisation de ces enzymes est nécessaire à la détermination du pouvoir pathogène, à l'étude des populations du parasite et à leur rôle dans l'établissement d'une phase de latence de Botrytis dans les cellules des jeunes raisins. La grande variabilité génétique de Botrytis lui confère une faculté d'adaptation exceptionnelle aussi bien à différentes plantes-hôtes qu'aux fongicides utilisés pour le combattre. La caractérisation des populations de Botrytis dans différentes cultures et au sein d'une même culture (p. ex. un vignoble) permet de savoir si ce parasite peut être spécifique à un hôte particulier et aussi d'étudier si des mouvements de populations de Botrytis entre espèces végétales sont possibles.
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Objectifs du projet
(Français)
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Définition du stade de développement de la vigne le plus sensible aux infections primaires. Etudes de l'incidence du taux d'infection floral sur le développement de la pourriture aux vendanges. Caractérisation biochimique et génétique des enzymes lytiques impliquées dans les infections florales et préparation d'anticorps et de sondes moléculaires comme outils de détection du parasite dans la plante-hôte en vue d'études épidémiologiques indispensables à l'établissement d'un système de prévision des risques de pourriture. La caractérisation génétique des populations de Botrytis permettra de déterminer, entre autre, le niveau de résistance des populations d'un vignoble à un fongicide donné et de tester l'homogénéité de ces populations avant l'installation d'essais de traitement.
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Mise en oeuvre et application
(Allemand)
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Für spezifische Informationen kontaktieren Sie bitte die angegebene Person.
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Mise en oeuvre et application
(Anglais)
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For more detailed information please contact the person in charge of the project
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Mise en oeuvre et application
(Français)
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Pour des informations supplémentaires veuillez contacter la personne indiquée.
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Mise en oeuvre et application
(Italien)
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Per ulteriori informazioni vogliate contattore il responsabile menzionato.
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Connaissances nouvelles/Littérature
(Français)
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Infections florales : de nombreux travaux ont été effectuées sur la pourriture grise des raisins, mais aucune publication ne se rapporte au développement épidémiologique du pathogène et à sa localisation et quantification durant la phase de latence. La présence de Botrytis dans les cellules du raisin après une infection florale a toutefois été mentionnée (Pezet, R., Pont, V. 1986. Revue suisse Vitic. Arboric. Hortic., 18 : 317-322).
Etudes génétiques de Botrytis : peu de travaux sont actuellement entrepris dans ce domaine. Citons toutefois quelques références relatives à la génétique de Botrytis : Giraud et al. Mol.Biol. Evol.14(11), 1177-1185 (1997); Van der Vlugt-Bergmans, C.J.B. et al. Mycol. Res. 97(10), 1193-1200 (1993); Faretra, F and Pollastro, S. Mycol. Res. 100(5), 620-624 (1996); Luck, J.E. and Gilling, M.R. Mycol. Res. 99(12), 1483-1488 (1995).
Etudes des enzymes lytiques : des laccases ont été purifiées (Slomczynski, D. et al., Appl. Environ. Microbiol.61(3), 907-912 (1995); Pezet, R., FEMS Microbiol. Letters 167, 203-208 (1998)) ainsi que des polygalcturonases et des cutinases (Gindro, K. and Pezet, R. FEMS Microbiol. Letters 171(2), 239-243 (1999); Johnston, D.J. et al. J. Exp. Bot.44(262), 971-976 (1993)). Ces enzymes sont impliquées dans le développement du champignon dans la plante hôte.
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Procédure/Etat des travaux
(Français)
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Infections artificielles dans les conditions du vignoble à différents stades de développement des inflorescences ; suivi de la germination des conidies sur les différentes parties des inflorescences, isolement du champignon et quantification (taux de baies infectées) durant la phase de latence ; corrélation entre les conditions climatiques durant la floraison et le taux de latence jusqu'à la véraison ; quantification de la pourriture visible aux vendanges et corrélation avec l'infection florale ; identification génétique des souches isolées par rapport à la souche de référence appliquée à la floraison. Isolement d'un grand nombre de souches de B. cinerea (quelques dizaines à plusieurs centaines selon les appuis techniques disponibles) provenant de différentes plantes-hôtes, de différents vignobles et éventuellement de différents pays et les caractériser morphologiquement, biochimiquement et génétiquement. Etudes phylogénétiques par programme statistique spécifique (Systat) des bandes révélées par PCR (primers du commerce). Etude de l'adaptation aux plantes-hôtes par infections croisées de populations isolées d'une plante-hôte sur une plante-hôte d'une autre espèce (PCR du DNA génomique fongique avant et après le changement de plante-hôte). Etude de la variabilité des populations de B. cinerea in vitro et PCR du DNA génomique. Etude de la variabilité génétique des populations au sein d'une même culture (p.ex. vignoble).
Aide à la mise en place de dispositifs expérimentaux (détermination de l'homogénéité des populations du pathogène dans les parcelles ; essais fongicides, test de résistance aux fongicides). Production d'anticorps et clonage des gènes de stilbène oxydase (laccases) et de cutinase. Recherche de l'expression des gènes de ces enzymes et production de sondes moléculaires. Modification génétique de B. cinerea (stilbox(-) et Cut(-)) pour évaluer le rôle de ces enzymes dans la pathogénèse. Production de primers spécifiques pour la détection de B. cinerea par PCR.
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Dépenses spécifiques au projet
(Français)
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Entretien et remplacement si nécessaire de matériel de purification de protéines (FPLC, colonnes et supports de biochromatographie) et de matériel d'électrophorèse (PAGE, IEF, transfert Western-blot, acides nucléiques). Valeur globale à neuf : Fr. 100'000.-
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Destinataires/Diffusion des résultats
(Français)
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Viticulteurs, Offices phytosanitaires cantonaux, Commission technique de Vitiswiss (PI), programme de sélection à la résistance aux maladies fongiques (RAC, IRAB, VTO), industrie (amélioration du modèle Luft HP-100 existant), communauté scientifique
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Publications / Résultats
(Allemand)
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Für spezifische Informationen kontaktieren Sie bitte die angegebene Person.
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Publications / Résultats
(Anglais)
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For more detailed information please contact the person in charge of the project
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Publications / Résultats
(Français)
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Pour des informations supplémentaires veuillez contacter la personne indiquée.
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Publications / Résultats
(Italien)
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Per ulteriori informazioni vogliate contattore il responsabile menzionato.
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