Mots-clé
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Banque de données, électrophorèse bidimensionnelle (2-DE), gel de références, protéomique
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Description succincte
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SWISS-2DPAGE regroupe les données concernant des protéines identifiées sur des gels d'électrophorèse bidimensionnelle.
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Objectifs du projet
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Etendre la base de données, les outils d'interrogation, et l'intégration d'autres bases de données protéomiques.
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Résumé des résultats (Abstract)
(Français)
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SWISS-2DPAGE est une banque de données de gels de référence d'électrophorèse bidimensionnelle d'échantillons biologiques variés tels que: liquides physiologiques, cellules et tissus humains et de souris, ainsi que d'autres organismes-modèles d'intérêt biologique. Outre ces images de références annotées, la base de données répertorie les protéines identifiées sur ces gels, ainsi que les informations expérimentales qui y sont associées. Toutes ces informations sont disponibles à toute la communauté scientifique via internet.
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Mise en oeuvre et application
(Français)
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Continuer la collaboration avec l'Université de Genève en vue de l'extension de la base de données, en particulier par la mise en œuvre des nouvelles techniques de protéomique à large échelle.
Continuer l'intégration de SWISS-2DPAGE avec les autres bases de données protéomiques disponibles sur le Web, en particulier avec les bases de données fédérées d'électrophorèse bidimensionnelle.
Continuer l'intégration avec le logiciel Melanie3, en particulier par l'utilisation des nouvelles possibilités d'annotation des images. Conséquemment proposer de nouveaux outils d'interrogation de la base de données via le serveur Web ExPASy.
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