Mots-clé
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banque de données, domaines protéiques, pattern, profile
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Description succincte
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La banque de données PROSITE documente en plusieurs formats des domaines structurels et fonctionnels trouvés dans les protéines.
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Objectifs du projet
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PROSITE doit être en 2003 une collection entièrement documentée, à jour, et toujours utile à la communauté scientifique; le but n'est toutefois pas de faire de PROSITE une collection exhaustive.
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Résumé des résultats (Abstract)
(Français)
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Durant les dix dernières années de nombreux outils informatiques ont été développés pour prédire la fonction biologique des protéines nouvellement identifiées.
Ces différentes techniques sont basées sur la conservation au cours de l'évolution des régions fonctionnelles. La fonction d'une protéine peut ainsi être prédite en comparant sa séquence avec celle de protéines déjà caractérisées biologiquement.
La banque de données PROSITE répertorie les régions fonctionnelles déjà caractérisées, et developpe les outils informatiques qui permettent d'identifier ces régions dans de nouvelles protéines.
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Mise en oeuvre et application
(Français)
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Mettre à jour la documentation PROSITE et intégrer de nouvelles entrées en se basant sur la littérature scientifique.
Découvrir de nouveaux domaines.
Effectuer un travail de recherche sur les différents algorithmes pour en améliorer la sensibilité.
La banque de données PROSITE est utilisée pour l'annotation de SWISS-PROT, elle a également servit à l'annotation du génome de la drosophile et du génome humain. Elle est disponible à toute la communauté scientifique via internet.
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