Surveillance génomique des maladies transmissibles dans les eaux usées 2024-2025

• Unité de recherche: OFSP
• Numéro de projet: 142006587
• Titre du projet anglais: Genomic surveillance of infectious diseases in wastewater 2024-2025

Mots-clé (Allemand)

Sequenzierung, Abwasser, SARS-CoV-2, respiratorische Viren, Abwasserreinigungsanlage

Mots-clé (Anglais)

Sequencing, wastewater, SARS-CoV-2, respiratory viruses, wastewater treatment plant

Mots-clé (Français)

Sequençage, eaux usées, SARS-CoV-2, virus respiratoires, station d’épuration des eaux usées

Description succincte (Allemand)

Die kontinuierliche genomische Überwachung im Abwasser erlaubt es, zeitnah einen Überblick über die aktuell zirkulierenden SARS-CoV-2 Virusvarianten in der Schweiz zu erhalten. Damit lassen sich Virusvarianten erkennen, welche Resistenzen gegen die Impfung oder Medikamente tragen oder zu schweren Krankheitsverläufen führen. Zudem lassen sich deren relativen Häufigkeiten abschätzen. Dies ist relevant um ggf. frühzeitig Massnahmen zu ergreifen. 
Die genomische Überwachung umfasst die:
- Sequenzierung von SARS-CoV-2 Genfragmenten in Abwasserproben, 
- bioinformatische Analyse der rohen Sequenzdaten zur Detektion der SARS-CoV-2 Virusvarianten und deren relativen Anteile,
- Prüfung der Anwendbarkeit dieser Methodik für andere respiratorische Viren.

Publications / Résultats (Allemand)

Die Ergebnisse der genomischen Überwachung von SARS-CoV-2 im Abwasser sind auf der Website der ETH Zürich abrufbar: Wastewater in Switzerland - Stories - covSPECTRUM (cov-spectrum.org)