Genomic surveillance of infectious diseases in wastewater 2024-2025

• Research unit: SFOPH
• Project number: 142006587

Key words (German)

Sequenzierung, Abwasser, SARS-CoV-2, respiratorische Viren, Abwasserreinigungsanlage

Key words (English)

Sequencing, wastewater, SARS-CoV-2, respiratory viruses, wastewater treatment plant

Key words (French)

Sequençage, eaux usées, SARS-CoV-2, virus respiratoires, station d’épuration des eaux usées

Short description (German)

Die kontinuierliche genomische Überwachung im Abwasser erlaubt es, zeitnah einen Überblick über die aktuell zirkulierenden SARS-CoV-2 Virusvarianten in der Schweiz zu erhalten. Damit lassen sich Virusvarianten erkennen, welche Resistenzen gegen die Impfung oder Medikamente tragen oder zu schweren Krankheitsverläufen führen. Zudem lassen sich deren relativen Häufigkeiten abschätzen. Dies ist relevant um ggf. frühzeitig Massnahmen zu ergreifen. 
Die genomische Überwachung umfasst die:
- Sequenzierung von SARS-CoV-2 Genfragmenten in Abwasserproben, 
- bioinformatische Analyse der rohen Sequenzdaten zur Detektion der SARS-CoV-2 Virusvarianten und deren relativen Anteile,
- Prüfung der Anwendbarkeit dieser Methodik für andere respiratorische Viren.

Follow up (German)

Anfragen zum weiteren Vorgehen sind an das Sekretariat Übertragbare Krankheiten zu richten:

Bundesamt für Gesundheit BAG
Direktionsbereich Prävention und Gesundheitsversorgung
Abteilung Übertragbare Krankheiten
Schwarzenburgstrasse 157
3003 Bern
Tel. [phone]
E-Mail : [e-mail]

Publications / Results (German)

Die Ergebnisse der genomischen Überwachung von SARS-CoV-2 im Abwasser sind auf der Website der ETH Zürich abrufbar: Wastewater in Switzerland - Stories - covSPECTRUM (cov-spectrum.org)

Die Überprüfung der Machbarkeit für andere respiratorische Viren erlaubte die genomische Überwachung auf Influenza A, RSV A und RSV B auszuweiten. Diese respiratorischen Viren werden im Winterhalbjahr überwacht. Die Ergebnisse sind ebenfalls auf der Website der ETH Zürich abrufbar: 
- Swiss wastewater - Influenza
- Swiss wastewater - RSV

Die Ergebnisse sind im WISE-Dashboard der Eawag und ETH Zürich (Wastewater Surveillance) bzw. im BAG-Infoportal IDD (BAG-Infoportal übertragbare Krankheiten) verfügbar.

 

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• Wastewater-based Genomic Surveillance of Communicable Diseases: Final report [PDF] 1'313 kB