National genomic SARS-CoV-2 surveillance programme

• Research unit: SFOPH
• Project number: 0142004449

Key words (German)

genomische Überwachung, Sequenzierung, SARS-CoV-2, Covid-19, COVID-19, besorgniserregende Variante

Key words (English)

genomic surveillance, sequencing, SARS-CoV-2, Covid-19, COVID-19, variant of concern (VOC)

Key words (French)

surveillance génomique, séquençage, SARS-CoV-2, Covid-19, COVID-19, variant préoccupant

Key words (Italian)

sorveglianza genomica, Sequenziamento, SARS-CoV-2, Covid-19, COVID-19, variante preoccupante

Short description (German)

Während der Covid-19-Pandemie war es nötig, die Entwicklung und Verbreitung der zirkulierenden SARS-CoV-2 Varianten genau zu beobachten. Virusarianten könnten die epidemiologische Situation beeinflussen, indem sie beispielsweise ansteckender sind, schwereren Krankheitsverlauf verursachen, der Immunität nach einer Infektion oder Impfung entgehen oder die Wirksamkeit von Therapien beeinflussen.
Diese Subvention ermöglichte eine geografisch und demografisch repräsentative Genomsequenzierung von 2000 Proben pro Woche. Dieses Projekt wurde vom Nationalen Referenzzentrum für neuauftretende Virusinfektionen (NAVI/CRIVE) am HUG koordiniert. Diese Überwachung ermöglichte die Entwicklung der Pandemie besser einzuschätzen und diente zudem als Entscheidungsgrundlage für eine zielgerichtete Anpassung von Massnahmen.

Short description (French)

Un suivi des variants du virus SARS-CoV-2 en circulation en Suisse est essentiel pour défénir les points clé la gestion de la pandémie. Variants du virus présentent des caractérsitiques pouvant influencer la situation épidémiologique, par exemple en étant plus contagieux, en causant une évolution grave de la maladie, en échappant à l’immunité après une infection ou une vaccination ou en influençant l’efficacité des thérapies. 
Cette subvention permet un séquençage du génome géographiquement et démographiquement représentatif de 2000 échantillons par semaine. Ce projet est coordonné par le Centre national de référence pour les infections virales émergentes (NAVI/CRIVE) aux HUG. Ce suivi permet l’évaluation de l’évolution de la pandémie et sert également de base décisionnelle pour la mise en place de mesures.

Follow up (German)

Anfragen zum weiteren Vorgehen sind zu richten an:

Bundesamt für Gesundheit BAG
Direktionsbereich Prävention und Gesundheitsversorgung
Abteilung Übertragbare Krankheiten
Schwarzenburgstrasse 157
CH-3003 Bern
Tel. [phone]
E-Mail: [e-mail]

Publications / Results (French)

Circulation des variants SARS-CoV-2 au niveau national et à Genève :
https://www.hug.ch/centre-maladies-virales-emergentes/programme-sequencage-national-du-sars-cov-2