Von der Forschung zum Betrieb: Umsetzung der Syndrom-Überwachung am Beispiel der Rinderpopulation in der Schweiz

• Forschungsstelle: BLV
• Projektnummer: 1.18.01

Schlüsselwörter (Deutsch)

Früherkennung, Syndrom-Überwachung, Tiergesundheitsdaten

Schlüsselwörter (Englisch)

Early detection, syndromic surveillance, animal health data

Kurzbeschreibung (Deutsch)

Das Bundesamt für Lebensmittelsicherheit und Veterinärwesen (BLV) hat viel in die Erarbeitung von Grundlagen für die Entwicklung eines Syndrom-Überwachungssystems (TGSyS) im Bereich der Tiergesundheit investiert. Das Zusammenführen des erarbeiteten Wissens, beurteilter Datenquellen sowie neu erworbener Hilfsmittel ist der nächste logische Schritt hin zum Betrieb eines nationalen SyS-Systems im Nutztiersektor. Ziel dieses Projekts ist es, die im Rahmen verschiedener Projekte gewonnenen Erkenntnisse in die Praxis umzusetzen und ein SyS-System für die Schweizer Rindviehpopulation als Pilot aufzubauen und zu betreiben. Da nach wie vor Klärungsbedarf besteht hinsichtlich der Fähigkeit der SyS, Krankheitsausbrüche frühzeitig zu erkennen, liegt der Fokus dieses Projekts auf möglichen zusätzlichen Nutzen wie der Kenntnis der aktuellen Gesundheits- oder Seuchensituation und dem gezielten Informationsfluss an verschiedene Interessentengruppen. Die Umsetzung des Pilotsystems erfolgt in enger Zusammenarbeit zwischen dem Fachbereich Früherkennung & Überwachung Tiergesundheit und der Abteilung Innovation des BLVs, sowie den betroffenen Stakeholdern im Hinblick auf die Einbindung privater Daten. Das Datawarehouse des BLV bietet eine geeignete und flexible Umgebung, um automatisierte Prozesse und Berichte zu generieren und eine Auswahl von Gesundheitsindikatoren für Rinder aus verschiedenen Datenquellen zu überwachen. Ergebnisse und Empfehlungen aus verschiedenen Projekten werden in die Auswahl geeigneter Methoden zur Aufbereitung und Überwachung der Datenströme einfliessen. Die auf verschiedenen Ebenen des Systems erzeugten Informationen werden regelmässig interessierten Kreisen wie Tierhaltern, Tierärzten, kantonalen Veterinärdiensten oder dem BLV zugänglich gemacht. Ihre Rückmeldung bezüglich dem Nutzen dieser Informationen wird regelmässig eingeholt und in die Weiterentwicklung der jeweiligen Berichte sowie Informations- und Management-Prozesse zwischen BLV, Veterinärdiensten und privaten Interessenten einfliessen. Dieses Projekt wird dem BLV ein funktionierendes TGSyS-System bereitstellen, das sich in die Arbeitsabläufe des Amtes integrieren lässt.

Kurzbeschreibung (Englisch)

The Swiss Federal Food Safety and Veterinary Office (FSVO) has invested substantial amounts of resources to generate fundamental knowledge and infrastructures required to develop a national animal health syndromic surveillance (AHSyS) system for the Swiss livestock population. A next logical step is to integrate existing knowledge, evaluated data sources and newly available tools to implement an operating national AHSyS system. The overall goal of this project is to put knowledge available from previous and current projects into practice by setting up a SyS system for the Swiss cattle population as a pilot. Since early detection of disease outbreaks is yet a SyS purpose that needs further clarification, this project will focus on additional expected benefits of SyS systems such as providing overall situational awareness and targeted reporting for different stakeholders. The pilot system will be implemented in close collaboration between the early detection and surveillance group and the innovation division of FSVO, together with the involved stakeholders of the cattle health network regarding the integration of private data. The FSVO’s data warehouse will provide a suitable and flexible environment to generate automated reports to monitor a selection of cattle health indicators from different data sources. Results and recommendations obtained from various projects will guide the selection of appropriate pre-processing and monitoring methods. Information generated at different levels of the system will routinely be made available to different stakeholders, including farmers, veterinary practitioners, local and national veterinary services. Their feedback concerning the usefulness of these information will be regularly assessed and used to improve the underlying reports as well as the information and management process between FSVO, veterinary services and private stakeholders. This project will provide a practical and functional technical solution of an AHSyS system that can be integrated into the FSVO’s activities and work routine.

Projektziele (Englisch)

The overall goal of this project is to move AHSyS in Switzerland from research towards practice. Knowledge gained during previous and current projects will serve as a basis to implement a SyS system for the Swiss cattle population as a pilot. Thus, the project’s emphasis will primarily be placed on putting evaluated indicators and aberration detection algorithms into practice rather than developing new methodologies. The pilot system will demonstrate proof of concept for AHSyS in Switzerland, focusing on additional expected benefits of SyS such as providing overall situational awareness and targeted reporting for different stakeholders. More specific, the objectives will be to

1. set up methodological and technical solutions for the FSVO to operate a SyS system for cattle

2. explore the role of ALVPH for AHSyS

3. explore what type of information can be produced by the pilot system, who will use it and for what purpose

4. improve the understanding of trends or developments in health indicators of the Swiss cattle population

 

The data warehouse ALVPH will provide an adequate environment for integrating data streams from different sources. Offering various tools for data mining, analysis and visualisation, it will enable to generate standardised reports. Its flexible infrastructure can be further extended e.g. by adding scripts for the open source software R[1].

 

Additional benefits resulting from AHSyS including situational awareness or targeted reporting for different stakeholders can be explored and exemplified e.g. using bovine virus diarrhoea (BVD). Automated reports analysing mortality (e.g. stillbirths, abortions) or reproduction (e.g. time between calving) data streams have the potential to provide relevant information for the surveillance and control of BVD. Projects such as RiBeS[2] and RiBeS[3] global may benefit by generating standardised reports that combine slaughtering and laboratory data to provide information for cantonal veterinary services on the current status and coverage of the RiBeS surveillance.

 

Furthermore, the project will enable to identify opportunities and limitations in operationalising an AHSyS system in Switzerland and to gain valuable practical experiences in operating such a system. Additionally, synergies with other projects will be investigated, e.g. project 1.15.13 with regard to using health-related animal data for prioritisation of identified contacts in case of a disease outbreak and/or using contact tracing to support investigation of a signal from SyS.

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[1] https://www.r-project.org/

[2] Cattle are sampled at the 7 largest Swiss slaughterhouses for surveillance of BVD, infectious bovine rhinotracheitis (IBR), enzootic bovine leucosis (EBL) and Bluetongue.

[3] A study to investigate how RiBeS can be extended to all Swiss slaughterhouses.

Abstract (Englisch)

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Zugehörige Dokumente

• DB 1.18.01 [PDF] 354 kB

URL-Adressen (Deutsch)

1.18.01 Hadorn; Von der Forschung zum Betrieb: Umsetzung der Syndrom-Überwachung am Beispiel der Ri…