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Research unit
FSVO
Project number
17MST
Project title
Microbial Source Tracking

Texts for this project

 GermanFrenchItalianEnglish
Key words
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Short description
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Project aims
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Abstract
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Publications / Results
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Inserted texts


CategoryText
Key words
(German)
Microbial Source Tracking; Wasser; fäkale Kontamination; Indikatoren
Short description
(German)

Das Lebensmittel Trinkwasser bildet eine der wichtigsten Lebensgrundlagen der Schweizer Bevölkerung. Die Trinkwasserqualität in der Schweiz ist zwar im internationalen Vergleich auf sehr hohem Niveau. Erkrankungen und Ausbrüche, die durch Trinkwasser verursacht werden, das mit Krankheitserregern kontaminiert ist, kommen jedoch auch in der Schweiz immer wieder vor. Diese Kontaminationen können von Fäkalien vom Menschen oder von Tieren stammen. Fäkalien menschlichen Ursprungs stellen dabei das grössere Risiko dar, als solche tierischer Herkunft.

Zur Beurteilung der mikrobiologischen Qualität von Trinkwasser wird das Konzept der Indikatorbakterien angewendet: Im Schweizer Lebensmittelrecht sind Toleranzwerte für AMK (aerobe mesophile Keime), Escherichia coli und Enterokokken festgelegt. Werden sie überschritten, zeigt dies an, dass die Trinkwasserqualität beeinträchtigt ist. Die Bakterien werden mit Kultivierungsverfahren zur Isolierung und zur Abschätzung ihrer Anzahl nachgewiesen. Mit diesen Methoden kann jedoch nicht unterschieden werden, ob eine Trinkwasserkontamination vom Menschen oder vom Tier stammt.

Das sogenannte Microbial Source Tracking (MST) stellt eine Weiterentwicklung dieses Konzeptes dar. Man versteht darunter den Einsatz von Mikroorganismen, die in Fäkalien gefunden werden, um die Herkunft von Wasserverunreinigungen in der Umwelt aufzuzeigen. Hierbei macht man sich die Tatsache zu Nutzen, dass gewisse Mikroorganismen (vor allem Bakterien und Viren) sich jeweils nur in Fäkalien von bestimmter Herkunft (wie zum Beispiel von Mensch, Rind oder Pferd) finden. Werden solche Indikatoren in verunreinigten Wasserproben nachgewiesen, kann dadurch der Ursprung des vorliegenden fäkalen Materials identifiziert werden. Unter Umständen kann mit den neuen Methoden die Kontamination sogar bis zu ihrer Quelle rückverfolgt werden, was gezielte Sanierungsmassnahmen ermöglicht.
Project aims
(German)
  1. Entwicklung eines "Werkzeugkastens" von Nachweisverfahren für Indikatoren, mit denen menschliche und tierische Kontaminationen in Wasser unterschieden werden können.
  2. Erprobung der Praxistauglichkeit der Methoden in Feldversuchen.
  3. Abgabe der Methoden an die Kantonalen Vollzugsorgane und die Rechtsunterworfenen durch das BLV in Form eines Handbuches mit Empfehlungen für die Anwendung in der Schweiz.
Abstract
(German)
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Abstract
(English)
Related documents
Publications / Results
(German)

Karabulut, F (2010): Microbial source tracking with Bifidobacteria, Rhodococci and multiresistant E. coli to discriminate faecal contaminations of human and animal origin in drinking water. Masterarbeit in Infektionsbiologie und Epidemiologie an der Universität Basel; Februar 2010.

Wicki M (2010): Identifying human and animal faecal contamination in surface and drinking water: new concepts and approaches. Dissertation, Philosophisch-naturwissenschaftliche Fakultät der Universität Basel; September 2010.

Wicki M, Auckenthaler A, Felleisen R, Tanner M, Baumgartner A (2011): Novel Bacteroides host strains for detection of human and animal specific bacteriophages in water. J. Water and Health, 9(1):159-68.

Wicki M, Karabulut F, Tanner M, Auckenthaler A, Felleisen R, Baumgartner A (2011): Identification of faecal input sites in spring water by the use of multiresistant Escherichia coli. Appl. Env. Microbiol., 77(23):8427f.

Wicki M, Auckenthaler A, Felleisen R, Liniger M, Loutre C, Niederhauser I, Tanner M, Baumgartner A (2012): Improved detection of Rhodoccocus coprophilus with a new real-time PCR assay. Appl. Microbiol. Biotechnol., 93(5):2161-9.

Diston D, Baumgartner A, Felleisen R (2012): Mikrobiologisches «Source Tracking» – Vielversprechende Ansätze. Water and Gas, 5:40-3.

Harwood VJ, Boehm AB, Sassoubre LM, Vijayavel K, Stewart JR, Fong TT, Caprais MP, Converse RR, Diston D, Ebdon J, Fuhrman JA, Gourmelon M, Gentry-Shields J, Griffith JF, Kashian DR, Noble RT, Taylor H, Wicki M (2013): Performance of viruses and bacteriophages for fecal source determination in a multi-laboratory, comparative study. Water Res., 47(18):6929-43.

Wicki M, Auckenthaler A, Felleisen R, Karabulut F, Niederhauser I, Tanner M, Baumgartner A (2015): Assessment of source tracking methods for application in spring water. J. Water Health, 13(2):473-88.

Diston D, Sinreich M, Zimmermann S, Baumgartner A, Felleisen R (2015): Evaluation of molecular- and culture-dependent MST markers to detect fecal contamination and indicate viral presence in good quality groundwater. Environ. Sci. Technol., 49(12):7142-51.

Diston D, Wicki M (2015): Occurrence of bacteriophages infecting Bacteroides host strains (ARABA 84 and GB-124) in fecal samples of human and animal origin. J. Water Health, 13(3):654-61.

Baumgartner A, Diston, Niederhauser I, Felleisen R (2016): Using Flow Cytometry and Bacteroidales 16S rRNA Markers to Study the Hygienic Quality of Source Water. J. Consumer Protection and Food Safety, 11:83–88.

Diston D, Robbi R, Baumgartner A, Felleisen R (2017): Microbial Source Tracking in Highly Vulnerable Karst Drinking Water Resources. J. Water Health, in press.

Diston D, Thomi R, Felleisen R, Baumgartner A, Jones B, Taylor H, Ebdon J, Caplin J, Purnell S, Dancer D, Ogilvie L (2017): Development of a novel TaqMan qPCR assay for phages infecting Bacteroides GB-124 – a potentially promising MST tool? Food Microbiol., submitted.