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Le Centre collabore avec la Division Maladies transmissibles de I'OFSP pour la lutte contre le développement de souche de microorganismes résistants aux traitements. Il gère le réseau électronique de surveillance de résistance aux antibiotiques en Suisse et assure l'analyse des données. En outre, en tant que Centre national de référence de l'antibiorésistance (CNAR ou NZAR en allemand), il offre un soutien aux autres laboratoires de microbiologie et participe à la rédaction de recommandations. Il est chargé de représenter la Suisse dans les contacts avec les laboratoires nationaux des autres pays et les réseaux de surveillance internationaux.
Récolte et analyse des données suisses de sensibilité aux antibiotiques des microorganismes commensaux et pathogènes pour l’homme ainsi que de la consommation des antibiotiques dans les hôpitaux de soins aigus.