Molekulargenetische Definition von Schweizerischen Grauviehpopulationen unter Verwendung genomweiter SNP Daten

• Unité de recherche: OFAG
• Numéro de projet: 09.17

Mots-clé (Allemand)

Grauvieh, Rind, genetische Diversität, SNP, gefährdete Rasse

Mots-clé (Anglais)

Grey cattle, cattle, genetic diversity, SNP, endangered breed

Description succincte (Allemand)

Es gibt im alpinen Raum mehrere Gauviehpopulationen, die in verschiedenen Zuchtverbänden organisiert sind. Da die Grauviehzucht in der Schweiz erst im Jahre 1985 mit Tiroler Grauvieh-Tieren aus Österreich wieder begründet wurde, stellt sich die Frage, ob die heutigen schweizerischen Grauviehpopulationen genetisch vom Tiroler Grauvieh abgegrenzt werden können. Zur Beantwortung dieser Frage sollen repräsentative Stichproben mit jeweils 50 Tieren aus folgenden Populationen untersucht werden:

1. Rätisches Grauvieh (Zuchtziel: Zweinutzungsrind)

2. Schweizer Braunvieh, Sektion Grauvieh (Zuchtziel: milchbetontes Zweinutzungsrind)

3. Mutterkuh Schweiz, Rassenclub Grauvieh (Zuchtziel: Fleischrind)

4. Tiroler Grauvieh

5. Original Braunvieh

Von jedem der insgesamt 250 für die Studie benötigten Tiere sollen ca. 54‘000 gleichmässig über das Genom verteilte variable Stellen (SNPs) typisiert werden. Diese hochauflösenden Genotypdaten werden dann mit verschiedenen Computerprogrammen einer Cluster-Analyse unterzogen, um zu überprüfen, welche der oben genannten Populationen genetisch abgrenzbar sind. Mit den Ergebnissen der Studie soll eine wissenschaftliche Grundlage für politische Förderentscheidungen zum Erhalt der Biodiversität von Rinderpopulationen geschaffen werden.

Description succincte (Anglais)

Today several grey cattle populations, which are managed by different breeding organizations, exist in the Alps. As the breeding of Swiss grey cattle was re-established only in 1985 using animals from the Tyrolean grey cattle breed, it is unclear whether the current Swiss grey cattle populations can be genetically distinguished from the Tyrolean grey cattle. In order to address this question, representative samples of 50 animals each from the following populations shall be investigated:

1. Rätisches Grauvieh (dual purpose)

2. Schweizer Braunvieh, Sektion Grauvieh (dairy/dual purpose))

3. Mutterkuh Schweiz, Rassenclub Grauvieh (beef)

4. Tyrolean grey cattle

5. Original Swiss Brown cattle

The 250 animals required for this project shall be genotyped at 54‘000 markers (SNPs) equally spaced throughout the genome. These highly informative genotype data will then be subjected to a cluster analysis using several different computer programs. The results of these analyses will show whether the above mentioned populations are genetically discernible. This project thus shall yield a scientific basis for political funding decisions regarding the conservation of endangered cattle breeds or the biodiversity in general.

Objectifs du projet (Allemand)

1. Probengewinnung von jeweils 50 repräsentativen Tieren aus 5 Rinderpopulationen

2. Genotypisierung der Proben mit dem bovinen illumina 54k SNP Chip

3. Auswertung der Daten und phylogenetische Analyse

Objectifs du projet (Anglais)

1. Sampling of 50 representative animals each from 5 cattle populations

2. Genotyping of these samples using the bovine illumina 54k SNP chip

3. Data extraction and phylogenetic analysis

Mise en oeuvre et application (Allemand)

Erhaltung gefährdeter Nutztierrassen

Mise en oeuvre et application (Anglais)

Conservation of endangered livestock breeds

Connaissances nouvelles/Littérature (Allemand)

Noch keine

Connaissances nouvelles/Littérature (Anglais)

None yet

Procédure/Etat des travaux (Allemand)

Aktuell findet die Beprobung ausgewählter Tier statt (Oktober 2009).

Procédure/Etat des travaux (Anglais)

The sampling of selected animals has started (october 2009).