Feasibility Study for a Multiplex Detection and Quantification of Plant Pathogens in Soil by a DNA-Macroarray

• Research unit: INNOSUISSE
• Project number: 9649.1;5 PFLS-LS

Short description (German)

Machbarkeitsstudie: Multiplexdetektion und Quantifikation von (Phyto-)Pathogenen mittels DNA-Macroarray

Short description (English)

Feasibility Study for a Multiplex Detection and Quantification of Plant Pathogens in Soil by a DNA-Macroarray

Abstract (German)

Für die Gewährleistung eines nachhaltigen Pflanzenbaus sowie den Schutz vor aggressiven und exotischen Organismen sind präzise Informationen über die Existenz agronomisch relevanter Phytopathogene in Produktionsmitteln eine Notwendigkeit. Im Rahmen der KTI-Machbarkeitsstudie wird ein Multiplex-Detektionsverfahren zur präzisen, schnellen und kosteneffektiven Identifikation und Quantifikation von Phytopathogenen entwickelt. Der Nachweis erfolgt mittels DNA-Macroarray über artspezifische DNA-Loci. Proben können damit auf ein breites Pathogenspektrum (bis 90 Pathogene) innerhalb 26 Stunden gescreent werden. Diese Methode zeichnet sich durch den quantitativen Aspekt sowie einer garantierten Zeitersparnis von mehreren Tagen aus. Der schnelle Nachweis ermöglicht die Qualitätssicherung bei Vollzugsbehörden, Landwirtschaft, Jungpflanzen-, Saatgut-, und Substratindustrie.