Weiterentwicklung von Methoden zur Auswertung von Stichproben-Daten

• Research unit: FSVO
• Project number: 1.05.09

Key words (German)

Bayesian Inference, Survey, Freedom from Disease, Porcine Reproductive and Respiratory Syndrom (PRRS), Classic Swine Fever, Transmissible Gastroenteritis

Key words (English)

Bayesian Inference, Survey, Freedom from Disease, Porcine Reproductive and Respiratory Syndrom (PRRS), Classic Swine Fever, Transmissible Gastroenteritis

Short description (German)

Im Wintersemester 2000/2001 wurden auf 2'543 Schweinezuchtbetrieben Blutproben von insgesamt 41'923 Zuchtsauen erhoben. Diese Proben wurden am Institut für Viruskrankheiten und Immunprophylaxe (IVI) in Mittelhäusern auf Aujeszky, PRRS, KSP und TGE untersucht. Die Anzahl zu beprobender Tiere pro Betrieb wurde nicht so ausgewählt, dass für jeden Betrieb dieselbe Herdensensitivität resultiert, was die Auswertung der Daten stark erschwert.
In einem ersten Ansatz wurde für jedem Betrieb aus der Testsensitivität, der zu erwartenden within-herd prevalence
im Falle einer Infektion, der Anzahl beprobter Tiere, sowie der totalen Anzahl Tiere die Herdenprävalenz berechnet. Darauf wurden die Betriebe in verschiedene Herdenprävalenz-Kategorien eingeteilt. Diese Kategorien wurden als unabhängige Stichproben betrachtet und nach dem Ansatz von Hadorn et al. (PVM, 2002) ausgewertet.
Neben diesem konservativen Ansatz existieren auch modernere Methoden, um Stichproben auszuwerten.
Das vorliegende umfangreiche und gut aufgearbeitete Datenmaterial bietet sich an, um solche moderne Methoden (z.B. Bayesian Ansätze) für die Auswertung von Stichproben anzuwenden und um diese Methoden miteinander zu vergleichen. Die Ergebnisse dieses Projektes sollen für die Publikation in einer internationalen Zeitschrift mit Peer Review aufgearbeitet werden.

Project aims (German)

An einem angewandten Beispiel methodische Kenntnisse und Werkzeuge erwerben, welche für zukünftige Planungen und Auswertungen von Stichproben aller Art angewendet werden können.

Abstract (English)

According to the SSE calculated for the main survey (2001), the overall probability of observing at least one infected herd based on survey sampling was 91.2% with a predefined HP of 0.1%. It was estimated by the simulation model that truly infected animals and herds could not be detected by the 2001 survey at the 99% confidence level since, at a 1% percentile, no true positive animals were predicted to have been included in the survey.

The probability of freedom from PRRS increased in 2001 from a prior median value of 89.3% (83.5% - 93.8%, 2.5th and 97.5th perc.) to a posterior value of 99.2% (97.7% - 99.7%). After the 2004 survey, the probability of freedom from PRRS reached a value of 99.7% (99.8% - 99.9%). It can be concluded that the pig industry in Switzerland is free of PRRS virus.

Transfer and application (German)

Umsetzungssitzung 2006
2-monatige Studie eines Gastwissenschaftlers aus Brasilien. Schweiz ist frei von PRRS.
Umklassifizierung der Seuche von „zu überwachende Seuche“ in „auszurottende Seuche“. Auswirkungen auf Gesetzgebung. Keine weitere Umsetzung nötig. Der Auftrag ist erledigt. (31.10.06/cbu)

Publications / Results (German)

Publications / Results (English)

Corbellini, L.G.; Schwermer, H.; Presi, P.; Thür, B.; Stärk, K.D.C.; Reist, M. (2006): Analysis of national serological surveys for the documentation of freedom from porcine reproductive and respiratory syndrome in Switzerland. Veterinary Microbiology 118, 267–273.

Corbellini, L.G., Schwermer, H., Presi, P., Thür, B., Stärk, K.D.C., Reist, M. Analysis of national serological surveys for the documentation of freedom from porcine reproductive and respiratory syndrome in Switzerland Prev.Vet.Med. (accepted)

 

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• Datenblatt [PDF] 63 kB