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Project number   04.21.2.7
Research unit  ACW (RAC)
Project title Développement d'outils moléculaires pour des études épidémiologiques, biochimiques et histologiques de différents pathogènes fongiques de la vigne
Project title in English Development of molecular tools for epidemiological, biochemical and histological studies of different grape berries fungal pathogens

Texts for this project

German French Italian English
Key words
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Short description
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Project aims
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Transfer and application
Anzeigen Anzeigen Anzeigen
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Knowlegde improvements / Publications
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Process / State of work
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Customers / Reporting
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Publications / Results
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Inserted texts


Category Text
 
Key words
(English)

Botrytis cinerea, Plasmopara viticola, Esca, enzymes, rDNA, in situ PCR, RT-PCR, RNA


Short description
(French)

Une lutte efficace contre les pathogènes fongiques de la vigne implique des connaissances de plus en plus fines sur l'organisme pathogène en question: ceci tant au niveau de sa physiologie, de sa génétique, de son mode de propagation et ses stratégies d'infection, que sur la modélisation de l'infection, le diagnostic, la détection précoce, de même que sur l'étude des mécanismes de résistance de la vigne contre ces différents pathogènes fongiques. L'étude des mécanismes de résistance de la vigne (induction d'enzymes particulières, par exemple stilbènes synthases, callose synthases contre Plasmopara viticola...) contre ces différents pathogènes au niveau moléculaire permet de mettre en évidence les gènes impliqués et d'étudier leur régulation, ce qui à long terme offre de nouvelles voies pour l'amélioration des plantes. L'obtention de marqueurs spécifiques (sonde moléculaire: ARNribosomique, enzymes particulières) contre ces mêmes pathogènes fongiques permettra de diagnostiquer plus rapidement la présence d'un champignon dans les tissus végétaux avant même l'apparition de symptômes. Ces outils moléculaires, combinés à de l'histologie (PCR in situ), permettent aussi de localiser le pathogène dans les tissus, ce qui est idéal par exemple dans l'étude de la latence de Botrytis cinerea dans les baies vertes de raisin.


Project aims
(French)

Botrytis: étude de la latence; détection très précoce de la présence de B. cinerea in vivo et localisation dans les tissus floraux
Mildiou: mécanismes de résistance du cépage Solaris et d'autres variétés résistantes au niveau moléculaire. Etude de l'expression de la stilbène synthase, de la calose synthase et de nouvelles enzymes impliquées dans les mécanismes de résistance.
Mise au point de marqueurs spécifiques à P. viticola utilisés dans la détection in vivo du pathogène.Esca: mise en place d'une mycothèque exhaustive. Détermination des espèces par la voie classique et par séquençage des régions ribosomiques. Identification des complexes fongiques de l'esca dans nos régions viticoles.


Transfer and application
(German)

Für spezifische Informationen kontaktieren Sie bitte die angegebene Person.


Transfer and application
(French)

Pour des informations supplémentaires veuillez contacter la personne indiquée.


Transfer and application
(Italian)

Per ulteriori informazioni vogliate contattore il responsabile menzionato.


Transfer and application
(English)

For more detailed information please contact the person in charge of the project


Knowlegde improvements / Publications
(French)

Un marqueur moléculaire spécifique à B. cinerea a été obtenu dans le cadre d'un travail de thèse (S. Rigotti sous la direction de O. Viret). Celui-ci peut donc être utilisé pour la mise au point des techniques de détection in situ du champignon en latence.
Des études microscopiques et histochimiques ont permis de mettre en évidence des mécanismes de défense particuliers chez le Solaris, un cépage résistant au mildiou. Actuellement, l'identification de mécanismes proches est en cours sur d'autres variétés résistantes.La connaissance des techniques moléculaires nécessaires à l'étude de ce mécanisme de résistance est maîtrisée. De plus, des techniques nouvelles sont en train d'être mises au point dans notre laboratoire.


Process / State of work
(French)

- Etude du suivi de l'infection primaire au niveau des phénomènes de surface (à savoir comportement des champignons dans les étapes précoces de développement, résistances mécaniques de la plante): ceci pourra se faire par l'utilisation de la microscopie électronique à balayage
- Mécanismes précis d'infection et d'envahissement des tissus : a) niveau végétal: mise en évidence des mécanismes de résistance et identification primaire des produits de résistance; b) niveau fongique: suivi de l'infection dans les tissus végétaux et sécrétions de produits permettant l'établissement de l'infection: ceci pourra se faire par l'utilisation de la microscopie électronique à transmission, de la microscopie à fluorescence et de l'histochimie en général
- L'identification et la caractérisation des protéines et enzymes responsables de la synthèse soit des produits de défense de la plante, soit des enzymes impliquées durant l'infection et sécrétées par l'organisme pathogène pourront se faire par des techniques de biochimie classique au sens large: dosage enzymatique, purifications successives sur colonnes, gels d'acrylamide.
- L'identification des enzymes impliquées dans l'infection précoce, tant au niveau végétal que fongique, permettra d'étudier les gènes responsables de leur synthèse. Ces gènes seront obtenus par des techniques d'amplifications au moyen d'amorces spécifiques. Dans un deuxième temps, l'étude de l'expression de ces gènes permettra d'évaluer l'importance de chacune durant les étapes précoces d'infection; ceci est rendu possible par des techniques de RT-PCR.- De nouveaux marqueurs spécifiques devront être élaborés afin d'identifier, localiser, ou/et de quantifier un pathogène dans les tissus végétaux: utilisation des amplifications par PCR, RAPD, PCR directe (article en cours), PCR quantitative, PCR in situ.


Customers / Reporting
(French)

Communauté scientifique; Sélectionneurs


Publications / Results
(German)

Für spezifische Informationen kontaktieren Sie bitte die angegebene Person.


Publications / Results
(French)

Pour des informations supplémentaires veuillez contacter la personne indiquée.


Publications / Results
(Italian)

Per ulteriori informazioni vogliate contattore il responsabile menzionato.


Publications / Results
(English)

For more detailed information please contact the person in charge of the project